很久很久以前，在红土大陆和伟大航路的交界附近，生长着一颗全长超过一万公尺的“神奇之树”，是一颗能够将树冠部分接收到的阳光传达到根部的树木——阳树夏娃；与此同时深海中树根的呼吸作用也为海底提供了充足的空气。基于这个奇迹，鱼人族在海底一万公尺的深海中，建立起了传说中的“龙宫王国”。但这个世上唯一一处有阳光照射的海底，并未因为阳光而变得光明。笼罩着这个王国的历史，是比海底一万公尺的深海更加深邃，也更加黑暗。
生活在同一片天地的众生，有哪一种是生而高贵，又有哪一种是生而卑微呢？可是“万物灵长”的人类统治者不这么认为，反而一手锻造“种族歧视”的枷锁。由于根深蒂固的种族观念，人类一直把鱼人族等同于鱼类来对待。哪怕生活在远离地面的一万公尺的深海中，人类的歧视和虐待依然鲜血淋漓的宰割着鱼人和人鱼。因此，仇恨、厌恶等负面情绪已经深深地扎根于鱼人族的血液中。
在“龙宫王国”的王族中一直流传着一个传说，每隔数百年鱼人族就会诞生一个能够与海王类心意相通的人鱼，号令整个海王类。“那个时候，整个世界就将改变！”其实这个传说源于大自然的神奇。众所周知，海王类无拘无束地生活在世界的任意一个角落，拥有这难以想象的力量和恐怖的体型，除了它们的王，无人能令它们臣服。它们的王被称为“海王”，而每一届海王都是以人鱼的姿态诞生。
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海圆历1510年，距大海贼时代开启已经过了十年
在大海上声名远播、无所畏惧的鱼人海贼团——太阳海贼团团长费舍尔·泰格受人所托，护送名为克尔拉的人类女孩返回遥远的故乡。身为奴隶的克尔拉，在太阳海贼团的帮助下稍微变得开朗一点了，诞生了一段特殊的友情。在泰格送克尔拉上岸返回故乡时，村民向海军透露了太阳海贼团的行踪，引来了本部少将带领海军的围剿。战争突然爆发，突遭横祸的太阳海贼团无奈只能夺取海军军舰逃离。及至彼时，船长泰格已深受重伤。在军舰上，曾为天龙人奴隶的泰格，宁死也不愿接受人类的鲜血，鱼人族的一精神支柱倒下了。临死前的泰格坦诚，乙姬王妃的主张是正确的，不过遭受非人对待的泰格却再也无法爱上人类。悲愤交加的阿龙失去了理智，回到岛上寻仇，发誓杀死所以人类，却被还是海军中将的黄猿逮捕，收押在世上最大监狱——推进城。
与此同时，新世界四皇之一的红发在最弱的东海失去一臂。
两年后，失去泰格的太阳海贼团团长甚平接到世界政府的“王下七武海邀请函”。为了鱼人族，在于鱼人族国王尼普顿商量之后甚平接受了邀请，同时原为奴隶或罪犯的鱼人族均被释放。出狱的阿龙无法接受甚平成为人类的走狗，与甚平抢夺船长位置失败，带领一部分同胞远走东海，妄图建立“阿龙帝国”，太阳海贼团就此分裂。
一天一艘巨大的船要求紧急进入龙宫王国，船上带着一个世界政府的标志。原因是世界贵族，天龙人穆斯卡尔特圣，意图抓回被释放的鱼人族奴隶而前往鱼人岛，在驾船途中不幸遭遇海怪袭击，最终在海难中意外抵达鱼人岛。许多鱼人族闻讯而来，把天龙人的船只围在了港口。仗着自己是世界贵族，慕斯卡尔特圣不断地叫嚣着“要把逃跑的奴隶重新抓回去”，却不知已然犯了众怒。就在原鱼人奴隶准备杀死天龙人的时候，突然赶到的乙姬王妃为天龙人挡下了子弹。在众人发愣的时候，受伤的慕斯卡尔特圣竟然抬起了枪口，对准了乙姬王妃，在危机关头，年仅六岁的白星公主意外的觉醒了远古的能力，巨型海王类不断在震骇无比的人群附近聚集，不知所措的人们都忘记了逃跑。在人群中观望的范德邓肯九世回过神来，仰天狂笑，趁乱溜到了白星面前，留下了靶靶果实的标记。
数星期后，天龙人在鱼人族的治愈下恢复了，并准备返回玛丽乔亚。为了证明陆地上是一个身体比正常人更虚弱的自己也能够安然无恙地生活的世界，乙姬王妃决定跟随慕斯卡尔特圣前往圣地玛丽乔亚。令人不安的情绪笼罩着鱼人岛，在度日如年的一周之后，王妃回国。同时，她还带回了可以被视为这座岛的希望的一纸承诺。再之后，乙姬王妃每天做演讲，请求人们在联署书上签字。乙姬王妃在龙宫城休息时，将流传已久的“王室传说”高诉了尼普顿三兄弟，就这样三兄弟与母亲约定，发誓守护妹妹白星的笑容。